昌平线南延工程西二旗至蓟门桥段，大致沿京新高速、小营西路、京藏高速、学清路、学院路、西土城路敷设，全为地下线。南延线路长12.6公里，新建车站7座。

7座车站由北向南分别是：清河站、上清桥站、学清路站、六道口站、学院桥站、西土城站、蓟门桥站。全线最大站间距2.82公里（位于清河站-上清桥站区间），最小站间距0.82公里（位于西土城站-蓟门桥站），平均站间距1.72公里。

昌平线南延示意图

7座车站中包括换乘站5座：清河站可换乘13号线和未来的19号线支线，上清桥站可换乘19号线，六道口站可换乘15号线，西土城站可换乘10号线，蓟门桥站可换乘正在建设的12号线。