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  • 使用强大的 T-ReX ® 算法进行数据预处理共作,进行保留时间对齐、去同位素峰和特征峰提取;
  • 目标化合物可以使用用户自定义的鉴定列表自动进行注释;
  • 未知物的鉴定,可通过数据库检索,计算机模拟二级碎片等方式鉴定;
  • 使用监督和无监督的统计学计算方法对复杂数据进行可视化,如 PCA、PLS、T-test 等;
  • 使用五个维度的指标对鉴定结果进行评分;
  • 代谢通路图匹配将鉴定到的代谢物显示到通路图中,从而将数据和已知信息结合;
  • 使用本地代谢物预测功能对药物代谢物进行预测并鉴定;
  • 批次间校正功能消除大队列样本带来的误差;
  • 时间序列图显示代谢物随时间的变化;
  • 针对脂质组学的注释工具包,包含 rule based annotation,4D Kendrick 质量缺陷图和 CCS 预测;
  • 为了简化已知物的鉴定,MetaboScape ® 支持 MetaboBASE 个人库、HMDB 代谢物库、布鲁克 Summer 植物库( 包括 > 130 化合物的 CCS 值 )以及客户自定义库
  • 可导出 GNPS ( Global Natural Products Social Molecular )支持的数据格式;
  • 客户端-服务器体系结构,单个许可证支持多台电脑同时安装,多个用户同时分析数据,数据和方法可共享;
  • MetaboScape ® 中的 Semi-Targeted 工作流程与 TASQ ® 软件的靶向绝对定量的流程可相结合。
  • 未知物鉴定流程:

    A) SmartFormula 3D 通过碎片和母离子的准确质量数和同位素峰信息将母离子可能的分子式进一步筛选,将最终的候选结果限制在一个或几个之内;

    B) CompoundCrawler 检索本地和公共数据库之后给出可能的结构式列表;

    C) MetFrag 计算机模拟理论二级碎片,与实测 MS/MS 谱图相匹配并打分;

    D) MS/MS 谱图关联匹配可寻找相类似的二级谱图,对结构可能相似的同类化合物进行鉴定。

    药物代谢物鉴定是药物研究中经常涉及到的研究内容,同时在代谢组学、表型组学、暴露组学和非靶向筛查中也有越来越多的涉及。研究对象主要为药物的代谢物或者环境毒物( 如农残、麻醉剂和其它有毒物质等 )在环境中的代谢产物。

    MetaboScape ® 内置的插件 BioTransformer 1 可实现本地的代谢物预测功能,只需输入药物原型即可推测代谢产物。支持代谢组学以及 SpatialOMx ® 空间多组学的数据分析。同时,还可获得时间序列图对代谢物随时间的变化情况进行半定量的追踪显示。

    ( [1] Djoumbou-Feunang et al.; Journal of Cheminformatics 2019, 11:2 ).

    MetaboScape ® 中最新的脂质注释规则流程中包含的脂质类别均遵循了脂质组学标准倡议( LSI )的规则。新的注释规则检索时运行更加快速,同时使用了类别注释的方法避免了过度注释。

    MetaboScape ® 可以在数据中查看 Kendrick 质量亏损图,即同类型化合物( 相差重复结构单元,如 CH 2 )的分布情况,这对于脂质鉴定结果的确证有着很大的帮助。4D Kendrick 质量亏损图包含 4 种信息( x 轴、y 轴、颜色和气泡大小 ),可从不同维度来查看数据。

  • 保留时间 - 质荷比图:不同的颜色表示不同类型脂质化合物的分布情况。这可以使研究者快速发现出现明显偏差的鉴定结果;
  • 质荷比 - CCS 值图:可看到同类型脂质,随着碳数增加,CCS 值线性增加;随着双键数增加,CCS 值线性降低。通过这一规律可快速去除假阳性结果;
  • 质荷比 - KMD( CH 2 )图:可以快速查看某一脂质类型的分布情况。KMD 值相同的代表脂质的不饱和度相同且脂质类型相同。图中所示的 TG,从颜色判断保留时间符合预期,CCS 值随着不饱和度的下降而升高。
  • TASQ ®

    TASQ®( Target analysis for screening and quantitation)软件是针对成百上千的样品批量进行筛查、确证和定量的分析软件。

    SCiLS™ Lab

    世界领先的质谱成像数据分析软件,可用于多个应用领域,如药物开发和转化病理学研究。SpatialOMx® 工作流程结合了 MetaboScape® 和 SCiLS™ Lab 软件,支持带有 CCS 值信息的 MALDI 成像数据的化合物( 代谢物、脂质、糖 )鉴定。