问 使用pip或pip3安装pyseer包时出现错误

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你的python是通过anaconda安装的吗？我知道重新安装有点痛苦，但我最终还是放弃了，昨晚就这么做了，这真的是安装Python包的最好方法。我只是用它来尝试安装 pyseer ，花了一些时间(~5 minutes+)，但它工作得很好，安装了一堆有用的依赖项，无论如何我都需要在某些地方安装这些依赖项：

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确保您的conda配置( conda config --add channels bioconda )中也添加了 bioconda (对于 conda-forge 也是如此)；但我认为这些都将是默认的。运行上面括号中的 conda config 命令至少会将 bioconda 移到它扫描的repos列表的顶部，这可能会加快包的下载速度，但是如果你主要安装生物信息学的东西的话。

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当然，通过anaconda提供的最新Python只有3.8。你仍然可以安装Py 10，但我确实可以，当我想使用从3.8开始添加的任何新东西时。(我只需要输入 python3.10 )

在 PyPI ( pip默认情况下查找包)或 TestPyPI (用于测试的PyPI实例)上都没有 pyseer 。 PySeer README 建议使用两种方法来安装软件包。

其中之一是Conda：

conda install pyseer

但是，您必须安装Conda，这可能有点困难。

另一个是pip。要使用pip，您必须下载(手动) from here (或使用Git克隆)，然后转到终端上的该目录并运行：

pip3 install .

(即使文档推荐使用 pip ， pip3 安装它也不会有问题)。

所以我想出了问题所在。显然，PIP3或PIP不适用于Pyseer，因为它在Windows中抛出了冲突的依赖错误。在Linux环境中使用Conda可以做到这一点( https://github.com/mgalardini/pyseer/issues/182 )。