建议学习路径

1. R、RStudio安装
2. ggplot2即可，不用学base绘图
3. 图片导出为PPT格式
4. 批量化处理
   1. for循环
   2. 可重复分析

   学完这些基本就能应对80%以上的分析任务了。

   视频推荐

   2018年我学的就是这个视屏，我也只推荐这个视屏作为R语言的快速入门视频： B站视频-R 语言入门与数据分析

   书籍推荐

   只推荐这么两本书：

   3. 《R 语言编程 — 基于 tidyverse》 ：R数据分析的最新书籍，也是我最推荐的书籍，尽量不要碰《R语言实战》这本书。
   4. R 语言数据可视化之美：专业图表绘制指南 ：几乎所有的数据可视化类型都有，有代码。

   博客推荐

   只推荐两个博客：

   5. 北京大学统计科学中心李东风老师R语言教程： https://www.math.pku.edu.cn/teachers/lidf/docs/Rbook/html/_Rbook/index.html
   6. 四川师范大学王敏杰老师R语言教程： https://bookdown.org/wangminjie/R4DS/author.html#author

   公众号推荐

   • YuLabSMU：顶级R语言开发大神Y叔公众号。
   • 生信技能树：我愿称之为国内生信最佳推广小组。
   • 生信媛：秀恩爱之余还不忘写代码的榜样。
   • 果子学生信：export包就是果子老师拯救的。
   • 红皇后学术：大量微生物相关的优秀内容。
   • 宏基因组：刘永鑫老师的公众号，强推。
   • 老俊俊的生信笔记：总是刷新认知的绘图大佬。
   • R语言数据分析指南
   • 生信菜鸟团
   • VisualHub：很少更新，一更新就是惊喜。
   • 微生信生物：南京农大文涛老师公众号，微生物组宏基因组。
   • 小白鱼的生统笔记：从原理到代码的标杆公众号。
   • 庄闪闪的R语言手册

   文献阅读

   优秀的文献是会释放代码和数据的，比如水稻微生物组经典文献：

   在材料与方法里面有这样一段话：

   也就是说他们的分析代码和数据都是公开的，如果想实现类似的分析，那么参考他们的代码就可以：

   All articles in this blog are used except for special statements CC BY 4.0 reprint policy. If reproduced, please indicate source 李详【Xiang LI】