AlphaFold-latest:人工智能在蛋白质结构预测领域的重大突破
文章:近日,DeepMind公司宣布其AlphaFold-latest模型在蛋白质结构预测上取得了显著的进步,这一技术的发展对于科研人员和制药行业来说具有重要的意义。
AlphaFold-latest模型采用了5120个token的方式评估系统性能,而且该系统能够在具有大量内存的加速器上运行更大的复合体。在模型中,每个输出结构都带有每个原子、每个标记对和聚合结构级置信度,结构中的每个实体以及结构内实体之间的每个接口都具有关联的置信度。
AlphaFold-latest能够单独或与蛋白质合作预测核酸(DNA或RNA)结构,这一功能使得它在预测蛋白质和配体位置时表现更优。在评估模型性能时,AlphaFold-latest在公开可用的CASP15 RNA靶标上的表现优于其他自动化方法,但略逊于目前最好的由人工专家干预的系统。
在技术报告的其他方面,论文研究了配体的准确性,并在两个数据集上进行了评估。在PoseBusters基准集中,AlphaFold-latest实现了准确的预测,但对接工具Vina和Gold却没有。AlphaFold-latest在联合预测蛋白质和配体位置时,可以对这些结合结构做出更好的预测。
AlphaFold-latest还可以预测含有共价修饰的结构,这一功能使得它在医学和制药领域具有更大的应用前景。网友热议纷纷期待AlphaFold在医学和制药领域会带来更多的奇迹。
自AlphaFold推出以来,DeepMind对系统进行了一系列改进,如今最新版本的AlphaFold可以对蛋白质数据库中的几乎所有分子进行预测。这一技术的进步无疑为科研人员和制药行业带来了巨大的便利,为人类健康和繁荣的未来做出了贡献。
上海交通大学
上海交通大学是教育部直属并与上海市共建的全国重点大学。学校的成立可追溯到1896年在上海创办的交通大学的前身南洋公学,至今已有125年历史。学校共有33个学院/直属系,12家附属医院,2个附属医学研究所,23个直属单位,5个直属企业。学校现有本科专业71个,涵盖经济学、法学、文学、理学、工学、农学、医学、管理学和艺术等九个学科门类;学校有17个学科入选国家“双一流”建设学科,位列全国高校第四;全校现有一级学科博士学位授权点47个,覆盖经济学、法学、文学、理学、工学、农学、医学、管理学等10个学科门类;一级学科硕士学位授权点56个,覆盖12个学科门类;有各类科技创新基地129个。科学研究与科技创新水平位于全国前茅。20年来,上海交通大学获得国家科技奖99项,上海市奖408项。2019年,获评国家科技进步特等奖;7个项目获得国家科技奖,总数位居全国第二;19项成果获评教育部“三大奖”;国家自然科学基金项目总数连续11年位列全国第一。2020年学校将获国家科技奖8项,居全国高校第二。教育部一等奖 7 项,居全国高校第三。上海市科学技术奖特等奖1项,一等奖21项。上海交通大学在人工智能领域具有扎实的学科基础和深厚的学术资源力量,不仅是国内最早启动人工智能平台建设的高校之一,还获准建设人工智能教育部重点实验室。交大在人工智能领域持续开展智能金融跨学科研究,推动人工智能场景应用,在推动科技与金融的结构化创新,提升金融科技核心能力上作出了重要贡献。上海交通大学在金融科技、智能风控、机器学习、大数据领域与企业展开合作,在运用于金融领域的深度学习、算法、模型上有丰富的研究成果和积淀。
格创东智(深圳)科技有限公司
工业互联网公司格创东智(深圳)科技有限公司(以下简称格创东智)2018年创立,以“格物智,创兴邦”命名,蕴含格创东智和它的战略孵化者TCL以科技创新实现制造强国的初心。2020年获得顶尖投资机构云锋基金亿元级A轮融资,成为云锋基金在工业互联网领域的首次投资。格创东智提出“面向生产现场”的工业互联网平台研发方向,通过深度融合人工智能、大数据、云计算等前沿技术,打造了新一代的APaaS平台——东智工业应用智能平台。基于该平台,格创东智围绕客户设备优化、品质提升、能耗降低等需求开发了设备健康管理、天枢人工智能视觉检测系统、GeekMind多因子分析工具等工业智能应用,其中《GeekMind多因子分析APP应用解决方案》获得“工信部2019年工业互联网APP优秀解决方案”称号。现阶段,东智工业应用智能平台及应用已经在半导体、精密电子、汽车零配件等行业落地,能为客户提供从边缘数据采集、工业大数据分析到顶层应用开发的一站式解决方案。格创东智深度融合人工智能(AI)、大数据、云计算等前沿技术与制造业经验,打造了行业首个聚焦生产现场的东智工业应用智能平台。通过AIxIoT赋能,提供场景化的智能制造解决方案,赋能一线生产工程师在平台上打造各类逻辑模型与工业应用,实现工业知识、经验的软件化和复用化。帮助制造业数字化、智能化升级,助力中国制造到中国智造转型升级。
广东德尔智慧工厂科技有限公司
公司成立于2005年,是一家以研发、生产、销售基于人工智能的智慧工厂管理领域整体解决方案为核心的国家高新技术企业。是2018年度、2019年度广东省“守合同重信用”企业、东莞市第十二批上市后备企业、广东省专精特新中小企业、东莞市倍增计划名誉试点企业、2020年广东省制造业企业500强(第408位)、广东省电池行业协会2020年度先进科技创新单位,2021年已通过国家专精特新“小巨人”。公司主导产品是智慧工厂一体化系统集成,属于新一代信息技术-智能化生产领域关键领域“补短板”。目前开展了基于物联网的资产健康平台环境管理软件、基于人工智能的资产健康平台健康管理软件等智能化生产领域关键核心技术攻关,填补了”智能化生产领域”国内空白。作为智慧工厂建设及管理的领军企业,积极参加与各新能源行业巨头包括宁德时代、欣旺达等企业的合作和联合创新。制定了《Q/DE 01-2020 资产健康管理(IFM)系统》等标准。公司智慧工厂一体化系统集成中“智慧工厂资产健康管理平台(IFM)”特色产品近三年的市场占有率和排名位于广东省电子信息行业同类产品前三名。通过布局印度,已经在印度有近亿元的订单,目前在新能源领域处于国内头部企业,达到国内领先水平。公司共申请专利约70余项,获授权实用新型专利39项,发明专利18项(其中2项已授权,16项处实审阶段),获授权软件著作36项。完成研发机构备案登记,目前建设了百级洁净实验室、万级洁净实验室、干燥实验室、自动化实验室等4个研发机构,计划联合合肥工业大学、广州中国科学院沈阳自动化研究所分所打造国家重点实验室。近两年研发经费支出占营业收入比重4.09%,。公司重视产品研发设计,计划每年研发经费将持续按不低于销售收入的4%投入,为技术中心的建设提供保障。