慈山寺為平衡參學質量、訪客安全、交通配套、寺院莊嚴、睦鄰關係，實行登記機制，祈能以境說法，淨化人心。公眾人士敬請透過慈山寺網上登記系統登記來寺參學。

登記參學一經確認，登記人將於一小時內收到確認電郵，內容包括參學編號、參學日期、進寺時間及參學人數。 參學人士進寺時必須向工作人員出示電郵或參學編號。 所有登記均不得轉讓。

個人(1-6人) 團體(20-50人) 由港鐵大埔墟站開往慈山寺，請於寺院門外下車。逢星期一至星期五 (公眾假期除外) 提供往來港鐵大埔墟站與慈山寺之服務。
由港鐵大埔墟站開出的班次為:上午9:15、9:45、下午1:15及1:45。
由慈山寺內迴旋處開出的班次為:上午11:30、下午12:00、12:30、1:00、1:30、3:30、3:50、4:10、4:30及5:00。
單程全票收費$8.3。