脚本如下，逻辑是读取根目录下的所有文件，以UTF-8 with BOM的编码格式打开，然后以UTF-8 without BOM的编码格式保存。如果文件本身是UTF-8 with BOM的编码格式，被处理后会将前面3个字节去掉。如果文件本身是UTF-8 without BOM的编码格式，那么会先以UTF-8 with BOM的编码格式打开（会在前面新增3个字节），然后再以UTF-8 without BOM的编码格式保存（去掉前面新增的3个字节），所以最终的结果是所有文件都被修改为UTF-8 without BOM的编码格式了。

import os
root_path = r"E:\haha"
count = 0
for path, subdirs, files in os.walk(root_path):
    for name in files:
        file = os.path.join(path, name)
        print(file)
        s = open(file, mode='r', encoding='utf-8-sig').read() # UTF-8 with BOM
        open(file, mode='w', encoding='utf-8').write(s) # UTF-8 without BOM
        count +=1
print("共",count,"个文件，转换完毕")
UTF-8 without BOM的文件示例（以16进制打开）
UTF-8 with BOM的文件示例（以16进制打开），可以看到前面多了3个字节，后面的内容和上面一样