题名
从SHAP到概率
其他题名
From SHAP to Probability——An Interpretable 0achine Learning Framework for Targeted Lipidomics Study on Diabetic Retinopathy
作者
发表日期
2023-08-25
发表期刊
中国卫生统计
影响因子和分区
语种
中文
原始文献类型
Periodical
关键词
脂质组学
可解释性机器学习
糖尿病视网膜病变
其他关键词
Lipidomics
; Interpretable machine learning
; Diabetic retinopathy
; SHAP
摘要
目的 基于可解释性机器学习算法构建糖尿病视网膜病病变(diabetic retinopathy,DR)的早期识别模型,并探讨SHAP(SHapley Additive exPlanations)在脂质组学数据中的应用.方法 基于本项目组的DR靶向脂质组学数据,通过可解释性机器学习的方法进行特征筛选;在建立糖尿病视网膜病变的早期识别模型后,通过全局、特征和个体三个层面对模型进行解释,并将SHAP值转换成概率以增强可解释的能力.结果 本研究筛选出了 5 种内源性脂质代谢物,构建了一个性能较为优秀的糖尿病视网膜病变的早期识别模型,并成功使用SHAP及概率解锁了模型.结论 脂质代谢物质可以应用于糖尿病视网膜病变的早期识别;SHAP在进行黑盒模型的解锁时表现出色,且有较高的实践应用价值.
资助项目
2021R413062:浙江省大学生科技创新活动计划;2020YFC2008201:国家重点研发计划;LGF19H260011:浙江省基础社会公益项目;81670777:国家自然科学基金
ISSN
1002-3674
卷号
40
期号:
4
页码:
511-515
DOI
10.11783/j.issn.1002-3674.2023.04.007
收录类别
万方
;
ISTIC
;
北大核心
;
CSCD
URL
查看原文
文献类型
期刊论文
条目标识符
https://kms.wmu.edu.cn/handle/3ETUA0LF/183949
专题
公共卫生学院
眼视光学院(生物医学工程学院)、附属眼视光医院
作者单位
1.温州医科大学公共卫生与管理学院(325000;
2.温州医科大学附属眼视光医院国家临床研究中心
第一作者单位
公共卫生学院
第一作者的第一单位
公共卫生学院
推荐引用方式
GB/T 7714
金东镇,郭城楠,彭芳,等. 从SHAP到概率[J].
中国卫生统计,2023,40(4):511-515.
金东镇., 郭城楠., 彭芳., 赵淑珍., 李慧慧., ... & 毛广运. (2023). 从SHAP到概率. 中国卫生统计, 40(4), 511-515.
金东镇,et al."从SHAP到概率".
中国卫生统计
40.4(2023):511-515.
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