在非洲，病例已经连续六周出现增加，在截至6月27日的一周内，病例数周同比增长25%，达到近20万2000例，达到非洲大陆之前22万4000例新病例记录的90%。同期，38个非洲国家的死亡人数增加了15%，达到近3000人。

随着非洲的病例数每三周翻一番，最早在印度发现的德尔塔变异体病毒正在越来越多的国家蔓延。目前，这种病毒已在16个非洲国家被发现，包括9个病例激增的国家。这是迄今为止最具传染性的病毒变种，估计比其他变种病毒的传播率高30%-60%。在截至6月27日的一周内，报告病例最多的五个国家中的三个国家出现德尔塔病毒蔓延趋势。南非同期占非洲病例的一半以上，而德尔塔病毒占主导地位。根据最新的国家报告，在乌干达测序的样本中有97%检测到德尔塔病毒变异体，在刚果民主共和国测序的样本中有79%检测到这一病毒变种。

在乌干达，45岁以下人群中66%的新冠严重病例可归因于德尔塔变异体。随着非洲大陆病例数和住院人数的增加，世卫组织估计，非洲的氧气需求现在比一年前的第一波疫情传播时的峰值高出50%。

另一方面，首先在英国发现的阿尔法病毒变体和首先在南非发现的贝塔病毒变异体已分别在32个和27个国家出现。北非、西非和中非的大多数国家都检测到了阿尔法变异病毒，而贝塔变异体在南部非洲更为普遍。这两种变异体都比原始病毒更容易传播。

尽管已有八种疫苗被证明是安全有效的，并已获得世卫组织批准，被列入紧急使用清单，但运往非洲的疫苗已经出现断档。目前非洲只有1500万人——仅占该大陆人口的1.2%——全面接种了疫苗。

世界卫生组织非洲区域办事处负责人莫提表示：“非洲第三波疫情的传播速度和规模前所未有。传染性更强的病毒变种的猖獗传播将新冠对非洲的威胁推向了一个全新的水平。更多的传播意味着更多的严重疾病和更多的死亡。每个人都必须现在就采取行动，加强预防措施，以防止紧急情况成为悲剧。”