《火焰纹章：晓之女神》的章数将比前作NGC的《火焰之纹章；苍炎之轨迹》大幅增加，前作中共有28章，而本作则将有44章。以战略性闻名的本作在平衡性上较《苍炎之轨迹》又更上一层楼，前作中出现的高低差系统在本作中除了影响移动、攻击范围外还将具有更深远的影响，而如武器、 魔法相性相克、死去的同伴无法复活等经典系统也都得以保留。

游戏共由四部组成，其中第一部是以米卡娅和沙扎为主人公，第二部是以克里米亚王国女王艾琳西娅为主人公。第一部的主人公光魔道士少女“米卡娅”是在《火焰之纹章：苍炎之轨迹》中登场的那位绿发少年盗贼沙扎的姐姐，而经过三年的历练，沙扎已经成长为一位男子汉，他现在终于找到了那位那位对自己十分重要的人，她就是 “米卡娅”。

故事是发生在《火焰之纹章：苍炎之轨迹》故事的3年之后，舞台同样是前作中的特里乌斯大陆，故事是从“迪因王国”的某个村落开始的。虽然前次的战争已经过去3年，但是迪因王国依旧是 满目疮痍，而由于迪因王国身为战败国失去大部分战力，因此受到山贼的侵扰，而米卡娅正是在这个时候出现并未了救助村庄挺身而出与山贼作战。

玩家在游戏初期时可以选择难度，这一设定相当照顾初次接触该系列的玩友，而老手也可以普通或困难模式进行游戏，系列难度高的特点将会充分体现。本作的画面与NGC版相比有明显进步，人物与场地看起来相当精细，使用魔法的效果十分华丽，人物动作也更为丰富，相信该作一定能够让广大爱好者满意。

与以往的火纹系列相比，本作系统作了不小的革新，调整了部分职业的能力值和特技，并可以直接继承前作《苍炎的轨迹》的存档以获得前作人物的能力武器熟练及道具金币等；游戏分为四个单元，一些人物也不想以往的纹章系列一旦说得就可以持续使用，几个角色即使加入也会在之后离队，二周目仍然能加入新的人物。

前作出现的特技槽和特技书习得后就无法卸下给他人，以及特技槽过小限制了它们的作用，在本作中则灵活和方便得多，不仅可以将用特技书习得的特技还原为书，甚至可以将同伴固有的特技还原为书，但不适用于锁定或习得对象限定的角色。

固有特技一般不占用特技槽，初期不熟悉系统时可暂时不要拆卸，熟悉后可自行安排组合。比较常用的特技利用方式是让低等级同伴习得エリ-ト来快速升级，较强同伴习得大器晚成来增加升级时提升的点数等等。游戏中针对下关的敌人临时装备上相应的种族特效特技、需要救出且战斗的学会护手、经常冲入敌阵的飞龙学会练达来消除自身弱点、武装解除+慈悲或者装备小手调之后偷盗敌人武器等等，使用的方法可谓变化万千，完全可以根据自己的需要和喜好来自由组合，自由度和游戏性都有明显提升。