首先看一下完整的报错:
Traceback (most recent call last):
File "train_cross-modal.py", line 414, in <module>
train()
File "train_cross-modal.py", line 292, in train
edge_time.to(device), edge_index.to(device), edge_type.to(device))
File "/home/amax/XJY/Semantic-Graph/Semantic-Graph/SGE-GNN/GNN/model.py", line 126, in forward
meta_xs = gc(meta_xs, node_type, edge_index, edge_type, edge_time)
File "/home/amax/.conda/envs/SGE1/lib/python3.7/site-packages/torch/nn/modules/module.py", line 532, in __call__
result = self.forward(*input, **kwargs)
File "/home/amax/XJY/Semantic-Graph/Semantic-Graph/SGE-GNN/GNN/conv.py", line 316, in forward
return self.base_conv(meta_xs, node_type, edge_index, edge_type, edge_time)
File "/home/amax/.conda/envs/SGE1/lib/python3.7/site-packages/torch/nn/modules/module.py", line 532, in __call__
result = self.forward(*input, **kwargs)
File "/home/amax/XJY/Semantic-Graph/Semantic-Graph/SGE-GNN/GNN/conv.py", line 59, in forward
edge_type=edge_type, edge_time = edge_time)
File "/home/amax/.conda/envs/SGE1/lib/python3.7/site-packages/torch_geometric/nn/conv/message_passing.py", line 126, in propagate
out = self.message(*message_args)
File "/home/amax/XJY/Semantic-Graph/Semantic-Graph/SGE-GNN/GNN/conv.py", line 111, in message
self.att = softmax(res_att, edge_index_i)
File "/home/amax/.conda/envs/SGE1/lib/python3.7/site-packages/torch_geometric/utils/softmax.py", line 23, in softmax
out = src - scatter_max(src, index, dim=0, dim_size=num_nodes)[0][index]
RuntimeError: CUDA error: invalid device function
Segmentation fault (core dumped)
我是在运行HGT代码的时候出现以上报错的,在网上搜了许多解决方案都没有办法解决,在google上面看到有人说这种报错往往出现在cudatoolkit包和系统中安装好的CUDA版本不匹配的时候。后来我想了一下有可能是pytorch-geometric包需要使用到cudatoolkit中的某些函数,如果不匹配就可能导致以上的错误(顺带一提pytorch-geometric包对环境的要求真的很严格)
于是我做了一个实验,把模型从使用GPU跑改为使用CPU跑,模型最终跑通了,一般情况下如果一个模型可以在CPU跑通而不能在GPU上跑十有八九就是环境配置出了问题,这更加证实了我之前的猜想。
后面我发现服务器上安装的CUDA版本是10.0版本,而我使用的cudatoolkit是10.1版本,把版本修改为cudatoolkit=10.0模型就可以跑通了。
BY THE WAY,很多同学在查看系统本身的CUDA版本的时候经常会用到两条指令
nvcc --version
nvidia-smi
在某一些情况下可能会出现两条命令查询出来的CUDA版本号不相同的问题,可以参考
https://zhuanlan.zhihu.com/p/345833286
。
我们以nvcc --version这条命令查询出来的CUDA版本为准